miR-218-1与其宿主基因SLIT2在食管癌中甲基化状态的研究

发布者:刘冉发布时间:2014-06-06浏览次数:519

microRNAmiRNA)是一类可参与内源性靶基因调节的非编码RNA,长度约为22-28个核苷酸,已有大量研究证实其异常表达可能导致肿瘤的发生,影响其发展和预后。而最近的研究显示,一些具有抑癌基因特性的miRNAs在肿瘤中的异常低表达是由于其编码基因CpG岛甲基化引起的,如miR-335, miR-663, miR-34b/c。在本实验室前期研究中,我们发现在肿瘤组织中miR-218的表达水平明显低于癌旁组织,提示miR-218可能发挥抑癌基因的功能,而这种异常低表达可能受启动子区DNA甲基化的调控。miR-218 编码基因位于 4p15.31  5q35.1,分别处于SLIT2SLIT3的内含子区(http://genome.ucsc.edu/)。通常认为内含子型miRNAs与宿主基因共转录,所以宿主基因启动子区CpG岛的DNA甲基化也会导致这些miRNAs的转录抑制,miR-218-1所处区域未见其它预测转录起始位点,因此预测其与所在宿主基因共用同一个启动子区,共同转录。根据预测,SLIT2启动子区位于Chr 420254678-20255227http://genome.ucsc.edu/version:GRCh37/hg19),选取此区域来研究miR-218-1的启动子区CpG岛甲基化状态。本次研究通过检测食管癌细胞株(EC9706,EC109)和20对食管癌组织及其相应癌旁组织中miR-218-1基因启动子区的甲基化水平,以及成熟miR-218在肿瘤组织和相应癌旁组织中的差异表达来探讨DNA甲基化对miRNA表达水平的影响,以及与食管癌发病间的联系,以寻找可用于食管癌早期诊断、治疗以及判断预后的分子标志物。方法:提取手术切除的20例食管癌组织及其相应癌旁组织中的总RNA和总DNA,将提取出的DNA进行亚硫酸盐修饰及纯化,再利用巢式甲基化特异PCRnested methylation-specific PCR)方法检测miR-218-1启动子区的DNA甲基化状态。提取的总RNA利用实时荧光PCR的方法检测20例癌组织和相应癌旁组织中miR-218表达水平。结果:两株食管癌细胞株(EC9706EC109)表现出了完全甲基化。20例食管癌组织中总体甲基化率为80%16/20),对应癌旁组织中总体甲基化率为35%7/20)。两者之间的差异有统计学意义(p<0.05)。而20对食管癌组织样本miR-218的表达水平明显低于其相应癌旁组织(p<0.05)。于此同时甲基化的组织中miR-218的表达水平明显低于未甲基化组织(9.98±1.78VS8.80±1.82p<0.05)。结论:食管癌中miR-218-1的高甲基化是频发事件,可能是miR-218低表达的重要原因,因而是食管癌的发生、发展的潜在标志物。