劳动卫生与环境卫生学系是由原劳动卫生学、环境卫生学、卫生毒理学、放射卫生学等4个教研室组合而成的学科系。学系1995年获得环境卫生学硕士学位授予权;2001年获得卫生毒理学硕士学位授予权;1998年环境卫生学获江苏省二类优秀课程;2000年劳动卫生与环境卫生学科获江苏省高校优秀学科梯队和铁道部医学重点学科;2003年获劳动卫生与环境卫生学博士学位授予权;2005年获卫生毒理学博士学位授予权;2006年劳动卫生与环境卫生学科获江苏省重点学科。该学系也是“生物材料与组织工程”博士点、"环境科学与工程”一级学科博士点的共建单位;是”基因诊断和基因治疗”江苏省医学重点实验室、江苏省生物材料重点实验室、“环境卫生学”江苏省医学重点建设学科的共建单位。是江苏省环境诱变剂学会理事长挂靠单位。
学系拥有一支年富力强、学历层次高,学术水平较高的教师队伍,其中教授、副教授各占教师队伍的43%,80%具有博士学位,50%以上的教师具有海外名校研修深造的背景;学系教师先后获得部级有突出贡献中青年专家、国务院特殊津贴、全国高校优秀骨干教师、江苏省“333工程”第二层次培养对象、江苏省青蓝工程骨干教师、江苏省创业优秀团队奖等荣誉表彰或称号。
在学科带头人浦跃朴教授的带领下,学系充分利用东南大学综合学科优势和,通过与环境工程、材料科学以及生物医学工程等学科的医工学科交叉结合,以开展高水平科学研究与研究生培养为中心,承担了一批国家、省部级科研项目,重点在太湖水污染治理、高发肿瘤病因学、纳米医学材料等领域取得一批高水平的科技成果,进而在环境与健康,肿瘤环境基因组学、环境污染物的分子与遗传毒理学、医学生物新材料与安全性评价、水质净化技术的基础研究、室内空气污染与健康等方面形成了稳定的研究方向。以该学科系为主要依托,建成了环境与健康公共创新平台—环境医学工程教育部重点实验室。实验室主任为国内著名卫生毒理学专家,中国环境诱变剂学会副理事长、江苏省环境诱变剂学会理事长浦跃朴教授。近五年来,随着学科建设水平、科研创新能力的不断提高,学系的建设发展迈上了一个新的台阶。先后承担有国家863、973、科技攻关、国家自然科学基金、科技部创业基金项目数十项,和一批省部级科研项目,获得科研经费2000余万元。获得省部级科技进步奖励二等奖2项、三等奖2项;市级一、二等奖各1项。在国内外学术刊物发表学术论文数百篇,其中被SCI、EI、ISTP收录100余篇。出版教材与专著4部。学科与相关工程学科合作,共申请专利29项,获得专利10余项。培养博士、硕士研究生近200名。